Bei der ganzheitlichen Behandlung der APM steht grundsätzlich nicht das Erscheinungsbild, sondern die Ursache einer Krankheit im Vordergrund. 

Demnach werden nicht ausschließlich Symptome behandelt, sondern nach Möglichkeit die Wurzel der Krankheit aufgespürt. Die chinesische Medizin vergleicht Krankheit mit einer Pflanze, die aus sichtbaren Zweigen und unsichtbaren Wurzeln besteht. 

Sobald an den Zweigen eine Krankheit in Erscheinung tritt, wird in den Wurzeln nach der Ursache gesucht und dementsprechend, die erste Behandlung angesetzt. 

Erst nach der Wurzelbehandlung wird man sich mit den Zweigen beschäftigen. 

Diese können z.B. Narben als Störfelder oder Blockaden in der Wirbelsäule sein.